Miễn thuế TNDN 3 năm: Nhiều doanh nghiệp mới đang bỏ lỡ!

Miễn thuế thu nhập doanh nghiệp 3 năm là gì?

Miễn thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) 3 năm là một chính sách ưu đãi thuế quan trọng của Nhà nước, cho phép doanh nghiệp không phải nộp thuế TNDN trong thời hạn 03 năm, nếu doanh nghiệp thuộc đúng đối tượng áp dụng và đáp ứng đầy đủ các điều kiện theo quy định pháp luật.

Chính sách này được ban hành nhằm:

• Hỗ trợ doanh nghiệp trong giai đoạn đầu hoạt động
• Giảm áp lực chi phí thuế hợp pháp
• Tạo điều kiện để doanh nghiệp tái đầu tư và tăng trưởng bền vững

Quy định cập nhật gần đây – doanh nghiệp cần đặc biệt lưu ý:

Theo Điều 7 Nghị định 20/2026/NĐ-CP, doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký kinh doanh lần đầu sẽ được hưởng ưu đãi:

✅ Miễn thuế thu nhập doanh nghiệp trong 03 năm

✅ Thời gian miễn thuế được tính liên tục, bắt đầu từ năm đầu tiên được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu

Điều này có nghĩa là thời gian miễn thuế không phụ thuộc vào việc doanh nghiệp đã có lợi nhuận hay chưa, mà được xác định theo mốc thời gian đăng ký kinh doanh lần đầu, đúng với tinh thần hỗ trợ doanh nghiệp ngay từ giai đoạn khởi sự.
 

📌 Bản chất của miễn thuế thu nhập doanh nghiệp

Một điểm rất quan trọng mà nhiều doanh nghiệp thường hiểu nhầm là: miễn thuế TNDN không phải là thủ tục ‘xin cấp phép’ riêng biệt. Trên thực tế, việc áp dụng ưu đãi thuế được thực hiện theo nguyên tắc tự khai – tự chịu trách nhiệm, cụ thể:

• Doanh nghiệp tự xác định mình có thuộc đối tượng được miễn thuế hay không
• Doanh nghiệp tự kê khai ưu đãi thuế trong hồ sơ thuế theo quy định
• Doanh nghiệp tự lưu trữ đầy đủ hồ sơ, chứng từ để chứng minh điều kiện hưởng ưu đãi
• Doanh nghiệp tự chịu trách nhiệm nếu cơ quan thuế kiểm tra, thanh tra và phát hiện sai sót

Chính vì vậy, việc hiểu đúng quy định ngay từ đầu và thực hiện kê khai chính xác đóng vai trò then chốt, giúp doanh nghiệp tránh rủi ro mất ưu đãi hoặc bị truy thu thuế về sau.

Căn cứ pháp lý về miễn thuế thu nhập doanh nghiệp

Chính sách miễn và giảm thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) hiện nay được xây dựng và áp dụng trong khuôn khổ hệ thống pháp luật về thuế, đồng thời gắn liền với chủ trương phát triển kinh tế tư nhân của Nhà nước trong giai đoạn mới.

Trước hết, Nghị quyết số 198/2025/QH15 của Quốc hội là văn bản mang tính định hướng, đặt nền tảng cho việc ban hành các cơ chế và chính sách đặc biệt nhằm thúc đẩy kinh tế tư nhân, trong đó có các nội dung liên quan đến ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp. Nghị quyết này thể hiện rõ chủ trương hỗ trợ doanh nghiệp, đặc biệt là doanh nghiệp nhỏ và vừa, trong giai đoạn khởi sự và phát triển.

Trên cơ sở đó, Nghị định số 20/2026/NĐ-CP của Chính phủ đã được ban hành nhằm quy định chi tiết việc miễn, giảm thuế, trong đó có nội dung rất quan trọng là miễn thuế thu nhập doanh nghiệp trong 03 năm đối với doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký kinh doanh lần đầu. Nghị định này có hiệu lực từ ngày 15/01/2026 và áp dụng cho kỳ tính thuế từ năm 2025, là căn cứ pháp lý trực tiếp để doanh nghiệp xác định và áp dụng ưu đãi miễn thuế TNDN 3 năm.

Bên cạnh đó, Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp năm 2025 (Luật số 67/2025/QH15) đóng vai trò là khung pháp lý nền tảng, quy định các nguyên tắc chung về thuế TNDN, điều kiện áp dụng ưu đãi thuế, cũng như các trường hợp không được hưởng ưu đãi. Luật này cũng nêu rõ những khoản thu nhập bị loại trừ khỏi diện ưu đãi, chẳng hạn như thu nhập từ chuyển nhượng vốn, chuyển nhượng bất động sản hoặc một số hoạt động đặc thù khác.
 

👉 Như vậy, để áp dụng đúng chính sách miễn thuế thu nhập doanh nghiệp 3 năm, doanh nghiệp cần đồng thời căn cứ vào chủ trương và định hướng tại Nghị quyết của Quốc hội, quy định chi tiết tại Nghị định của Chính phủ và các nguyên tắc, điều kiện chung được quy định trong Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp. Việc hiểu đúng và áp dụng đồng bộ các văn bản này sẽ giúp doanh nghiệp hưởng ưu đãi thuế một cách hợp pháp, an toàn và bền vững, đồng thời tránh rủi ro bị loại ưu đãi hoặc truy thu thuế về sau.

Từ các quy định pháp lý nêu trên, có thể thấy rằng chính sách miễn thuế thu nhập doanh nghiệp 3 năm không áp dụng cho tất cả doanh nghiệp. Việc được hưởng ưu đãi này phụ thuộc vào đối tượng cụ thể mà pháp luật quy định, bao gồm loại hình doanh nghiệp, thời điểm đăng ký kinh doanh và một số điều kiện liên quan.

👉 Vì vậy, để biết doanh nghiệp của bạn có thuộc diện được miễn thuế TNDN 3 năm hay không, trước hết cần xác định rõ những đối tượng được áp dụng ưu đãi này, sẽ được trình bày ngay dưới đây.

Đối tượng được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp 3 năm

Doanh nghiệp mới thành lập

Doanh nghiệp mới thường gặp:

1. Thiếu vốn, dòng tiền yếu
2. Doanh thu chưa ổn định
3. Chi phí ban đầu cao (thuê mặt bằng, nhân sự, marketing, phần mềm…)

🎯 Miễn thuế giúp:

• Giữ lại lợi nhuận để tái đầu tư
• Tăng sức bền tài chính 1–3 năm đầu
• Tạo đà tăng trưởng nhanh

⚠️ Nhưng cần nói rõ cho đúng luật không phải mọi doanh nghiệp mới thành lập đều được miễn TNDN 3 năm. Cơ chế miễn 3 năm đang được nêu rõ cho doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký kinh doanh lần đầu theo Nghị định 20/2026/NĐ-CP.

Doanh nghiệp thuộc lĩnh vực ưu đãi đầu tư

Các lĩnh vực ưu đãi thuế (tuỳ quy định và điều kiện dự án) thường được người đọc quan tâm: CNTT, phần mềm, khoa học – công nghệ, y tế, giáo dục, môi trường, năng lượng sạch, công nghệ cao…

📌 Lưu ý: phần này là “nhóm ưu đãi thuế theo đầu tư/lĩnh vực” – khác với cơ chế “miễn 3 năm cho SME đăng ký lần đầu”.

Bảng:Các lĩnh vực và mức độ được hưởng ưu đãi thuế TNDN

Lĩnh vực hoạt động	Mức độ được hưởng ưu đãi thuế	Yếu tố doanh nghiệp cần làm rõ
Phần mềm, công nghệ thông tin	⭐⭐⭐⭐☆	Hoạt động công nghệ, sản phẩm phần mềm, đổi mới sáng tạo
Giáo dục, y tế	⭐⭐⭐⭐☆	Tính xã hội hóa, phục vụ cộng đồng, lĩnh vực ưu tiên
Môi trường, năng lượng sạch	⭐⭐⭐⭐☆	Mục tiêu bảo vệ môi trường, phát triển bền vững
Thương mại thông thường	⭐⭐☆☆☆	Ít chính sách ưu đãi, cần xét thêm điều kiện khác

Doanh nghiệp hoạt động tại địa bàn ưu đãi thuế

📍 Thường là địa bàn có điều kiện kinh tế – xã hội:

• Khó khăn
• Đặc biệt khó khăn

🎯 Mục tiêu:

• Thu hút đầu tư
• Phát triển địa phương
• Tạo việc làm

Doanh nghiệp công nghệ, đổi mới sáng tạo

Theo hướng dẫn tại Nghị định 20/2026, nhóm liên quan hệ sinh thái khởi nghiệp đổi mới sáng tạo có thể được ưu đãi thuế theo cơ chế riêng, ví dụ:

• Miễn TNDN 02 năm
• Giảm 50% số thuế phải nộp trong 04 năm tiếp theo với thu nhập từ hoạt động khởi nghiệp đổi mới sáng tạo (kèm quy tắc tính thời gian ưu đãi).

Điều kiện để được hưởng miễn thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) 3 năm

Để được áp dụng miễn thuế TNDN 3 năm, doanh nghiệp cần đáp ứng đồng thời các điều kiện về ngành nghề, thời điểm áp dụng và hồ sơ pháp lý. Việc hiểu sai hoặc bỏ sót một trong các điều kiện này có thể khiến doanh nghiệp mất quyền ưu đãi ngay từ đầu.

Điều kiện về ngành nghề kinh doanh

Để áp dụng ưu đãi thuế một cách an toàn và hợp pháp, doanh nghiệp cần đảm bảo:

✅ Ngành nghề đăng ký phù hợp với hoạt động thực tế

✅ Không thuộc các khoản thu nhập hoặc hoạt động bị loại trừ ưu đãi theo quy định của pháp luật thuế (tham chiếu Điều 18 Luật Thuế TNDN 2025)

Trên thực tế, nhiều doanh nghiệp bị loại ưu đãi không phải vì không đủ điều kiện, mà do đăng ký ngành nghề không rõ ràng hoặc không chứng minh được hoạt động thực tế.

🔎 Checklist tự rà soát nhanh

1. Mã ngành đăng ký đã đúng với hoạt động thực tế chưa?
2. Hoạt động kinh doanh có thể chứng minh bằng hợp đồng, hóa đơn, sản phẩm, dịch vụ hay không?
3. Hồ sơ, chứng từ liên quan đã được lưu trữ đầy đủ chưa?

Điều kiện về thời điểm phát sinh thu nhập

Đối với miễn thuế TNDN 3 năm áp dụng cho doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký kinh doanh lần đầu, thời gian miễn thuế được tính liên tục từ năm được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu, không phụ thuộc vào việc doanh nghiệp đã có lợi nhuận hay chưa.

Điều này khác với một số cơ chế ưu đãi thuế khác, vốn chỉ bắt đầu tính ưu đãi từ năm đầu tiên phát sinh thu nhập chịu thuế.

📊 Cách hiểu đúng để tránh áp dụng sai

• Doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký kinh doanh lần đầu

→ Miễn thuế TNDN 03 năm liên tục kể từ năm được cấp GCN ĐKDN lần đầu

• Ưu đãi đối với thu nhập từ hoạt động khởi nghiệp đổi mới sáng tạo

→ Thời gian ưu đãi được tính từ năm đầu tiên có thu nhập chịu thuế từ hoạt động ưu đãi

→ Trường hợp 03 năm đầu chỉ phát sinh doanh thu nhưng chưa có thu nhập chịu thuế, thời gian ưu đãi có thể được tính từ năm thứ tư, theo hướng dẫn cụ thể

👉 Việc xác định đúng mốc thời gian áp dụng ưu đãi là yếu tố then chốt để không bị loại quyền miễn thuế.

Điều kiện về hồ sơ, thủ tục pháp lý

Để hưởng ưu đãi thuế một cách bền vững, doanh nghiệp cần xây dựng tư duy quản trị thuế đúng chuẩn ngay từ đầu, bao gồm:

1. Kê khai thuế đúng hạn theo kỳ và quyết toán năm
2. Báo cáo tài chính minh bạch, số liệu khớp sổ sách và chứng từ
3. Lưu trữ đầy đủ hồ sơ chứng minh đối tượng ưu đãi, như:

• Doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký lần đầu
• Thu nhập từ hoạt động khởi nghiệp đổi mới sáng tạo (nếu áp dụng)

 

Thời gian miễn thuế thu nhập doanh nghiệp được tính như thế nào?

Việc xác định đúng thời gian bắt đầu và kết thúc thời gian miễn thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) là yếu tố then chốt giúp doanh nghiệp tránh rủi ro áp dụng sai ưu đãi, bị cơ quan thuế điều chỉnh hoặc truy thu về sau.

Trên thực tế, rất nhiều doanh nghiệp đủ điều kiện miễn thuế nhưng vẫn mất quyền lợi chỉ vì hiểu sai mốc thời gian áp dụng.

🔹 Nguyên tắc áp dụng thời gian miễn thuế TNDN

▶️ Doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký kinh doanh lần đầu

• Doanh nghiệp được miễn thuế TNDN trong 03 năm liên tục
• Thời gian miễn thuế được tính từ năm đầu tiên được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu
• Không phụ thuộc vào việc doanh nghiệp đã có lợi nhuận hay chưa

👉 Đây là điểm rất quan trọng, bởi nhiều doanh nghiệp nhầm lẫn rằng phải có lãi mới được tính thời gian miễn thuế, dẫn đến áp dụng sai quy định.

▶️ Doanh nghiệp có thu nhập từ hoạt động khởi nghiệp đổi mới sáng tạo

• Thời gian ưu đãi được tính từ năm đầu tiên phát sinh thu nhập chịu thuế từ hoạt động ưu đãi
• Trường hợp trong 03 năm đầu chỉ có doanh thu nhưng chưa có thu nhập chịu thuế, thời gian ưu đãi có thể được tính từ năm thứ tư, theo hướng dẫn cụ thể của pháp luật thuế

👉 Cơ chế này khác với ưu đãi dành cho doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký kinh doanh lần đầu, vì vậy doanh nghiệp cần xác định đúng loại ưu đãi đang áp dụng.

▶️ Trường hợp doanh nghiệp đồng thời đủ điều kiện hưởng nhiều ưu đãi thuế

• Doanh nghiệp được quyền lựa chọn ưu đãi có lợi nhất
• Ưu đãi đã lựa chọn phải được áp dụng ổn định và xuyên suốt trong toàn bộ thời gian ưu đãi

📌 Lưu ý: Doanh nghiệp không được thay đổi qua lại các loại ưu đãi trong cùng một giai đoạn nếu không có căn cứ pháp lý rõ ràng.

Lợi ích khi doanh nghiệp được miễn thuế TNDN 3 năm

Miễn thuế thu nhập doanh nghiệp trong 03 năm đầu mang lại lợi ích tài chính rất lớn, đặc biệt đối với doanh nghiệp mới thành lập – giai đoạn cần nhiều nguồn lực để tồn tại và phát triển.

💡 Những lợi ích nổi bật

• Giảm chi phí thuế hợp pháp

→ Doanh nghiệp không phải nộp thuế TNDN trong thời gian ưu đãi, giúp tăng lợi nhuận giữ lại

• Tăng dòng tiền hoạt động

→ Có thêm nguồn vốn để xoay vòng, thanh toán chi phí, mở rộng quy mô kinh doanh

• Ổn định tài chính trong giai đoạn đầu

→ Giảm áp lực dòng tiền, hạn chế nguy cơ thiếu vốn hoặc vay nợ sớm

• Cải thiện hiệu quả kinh doanh

→ Lợi nhuận sau thuế cao hơn, chỉ số tài chính lành mạnh hơn

• Tăng khả năng cạnh tranh trên thị trường

→ Có thêm ngân sách cho marketing, phát triển sản phẩm, tuyển dụng nhân sự chất lượng

👉 Miễn thuế TNDN 3 năm giúp doanh nghiệp giữ lại dòng tiền trong giai đoạn đầu để tái đầu tư và tạo nền tảng tăng trưởng bền vững.

Những sai lầm khiến doanh nghiệp mất quyền miễn thuế TNDN

Bên cạnh các lỗi nghiệp vụ kế toán – thuế, nhiều doanh nghiệp còn vô tình rơi vào các trường hợp bị loại trừ ưu đãi do thiếu thông tin hoặc hiểu sai quy định.

⚠️ Các sai lầm phổ biến doanh nghiệp thường gặp

❌ Kê khai thuế ban đầu sai
→ Khó điều chỉnh về sau, có thể bị loại ưu đãi ngay từ năm đầu

❌ Không theo dõi mốc 03 năm miễn thuế
→ Áp dụng sai thời điểm, dẫn đến bị truy thu thuế

❌ Hiểu nhầm rằng doanh nghiệp mới nào cũng được miễn thuế 3 năm
→ Thực tế chỉ áp dụng cho doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký kinh doanh lần đầu theo Nghị định 20/2026/NĐ-CP

❌ Thuộc các trường hợp không được áp dụng ưu đãi, bao gồm:

• Doanh nghiệp thành lập do sáp nhập, hợp nhất, chia, tách, chuyển đổi

• Thu nhập từ chuyển nhượng vốn, chuyển nhượng bất động sản

• Các trường hợp đặc thù khác bị loại trừ theo quy định pháp luật

Hồ sơ và thủ tục miễn thuế thu nhập doanh nghiệp

Hồ sơ cần chuẩn bị

Để áp dụng miễn thuế TNDN đúng quy định, doanh nghiệp cần chuẩn bị đầy đủ các hồ sơ sau:

• Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp (đăng ký lần đầu)
• Hồ sơ chứng minh doanh nghiệp nhỏ và vừa theo tiêu chí pháp luật
• Báo cáo tài chính, sổ sách kế toán, chứng từ hợp lệ
• Tờ khai và quyết toán thuế TNDN theo kỳ và theo năm

👉 Việc chuẩn bị hồ sơ đầy đủ ngay từ đầu giúp doanh nghiệp giảm rủi ro khi cơ quan thuế kiểm tra.

Quy trình kê khai miễn thuế TNDN 

Doanh nghiệp có thể thực hiện theo 3 bước cơ bản:

• Xác định đúng cơ chế ưu đãi đang áp dụng (Doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký lần đầu / khởi nghiệp đổi mới sáng tạo / ưu đãi khác)
• Kê khai và quyết toán thuế đúng quy định, thể hiện rõ nội dung miễn thuế TNDN
• Lưu trữ đầy đủ hồ sơ, chứng từ để sẵn sàng giải trình khi cơ quan thuế kiểm tra hoặc thanh tra

Doanh nghiệp có bắt buộc đăng ký miễn thuế TNDN không?

Miễn thuế thu nhập doanh nghiệp không tự động được áp dụng nếu doanh nghiệp không xác định và kê khai đúng.

Doanh nghiệp cần:

• Tự xác định mình có đủ điều kiện hưởng ưu đãi hay không
• Tự kê khai và quyết toán thuế theo quy định
• Tự lưu trữ hồ sơ chứng minh
• Tự chịu trách nhiệm khi cơ quan thuế kiểm tra, thanh tra

👉 Nếu kê khai sai hoặc không kê khai, doanh nghiệp có thể mất hoàn toàn quyền miễn thuế. Để tránh kê khai sai ngay từ năm đầu, các doanh nghiệp  hãy lựa chọn dịch vụ kế toán thuế trọn gói để được theo dõi mốc ưu đãi và hồ sơ đầy đủ.

Dịch vụ tư vấn miễn thuế TNDN – Giải pháp an toàn cho doanh nghiệp

Khi nào doanh nghiệp nên sử dụng dịch vụ tư vấn thuế?

• Doanh nghiệp mới thành lập, đặc biệt trong năm đầu hoạt động
• Không có kế toán nội bộ hoặc chưa am hiểu sâu về ưu đãi thuế
• Mong muốn tối ưu thuế hợp pháp, hạn chế rủi ro truy thu

Lợi ích khi sử dụng dịch vụ tư vấn chuyên nghiệp

✅ Rà soát điều kiện miễn thuế TNDN 3 năm theo Nghị định 20/2026/NĐ-CP

✅ Chuẩn hóa hồ sơ, kê khai đúng mốc thời gian

✅ Theo dõi thời gian ưu đãi, lựa chọn phương án có lợi nhất

✅ Kết hợp các dịch vụ hỗ trợ doanh nghiệp:

• Dịch vụ kế toán – kế toán thuế trọn gói
• Dịch vụ kiểm toán
• Dịch vụ thành lập doanh nghiệp,...
• Tư vấn hộ kinh doanh, chuyển đổi hộ kinh doanh lên doanh nghiệp

❓ Câu hỏi thường gặp (FAQ)

1. Doanh nghiệp mới có được miễn thuế TNDN 3 năm không?

  Trả Lời :  Chỉ áp dụng cho doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký kinh doanh lần đầu theo Nghị định 20/2026/NĐ-CP.

2. Không kê khai miễn thuế có mất quyền lợi không?

  Trả Lời : rủi ro rất cao, vì ưu đãi gắn với việc xác định đúng đối tượng, mốc thời gian và hồ sơ chứng minh.

3. Hộ kinh doanh có được miễn thuế TNDN không?

  Trả Lời : Không. Hộ kinh doanh không áp dụng thuế TNDN mà chịu thuế GTGT và thuế TNCN theo quy định.

4. Có nên chuyển hộ kinh doanh lên doanh nghiệp?
  Trả Lời : Nên cân nhắc khi doanh thu tăng, cần hóa đơn, muốn quản trị thuế bài bản và tiếp cận các ưu đãi phù hợp.

Miễn thuế thu nhập doanh nghiệp 3 năm là một ưu đãi rất giá trị, đặc biệt đối với doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký kinh doanh lần đầu theo Nghị định 20/2026/NĐ-CP, với thời gian miễn thuế được tính liên tục từ năm cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu.

👉 Để hưởng ưu đãi an toàn và bền vững, doanh nghiệp cần thực hiện đúng ngay từ đầu: xác định đúng đối tượng – theo dõi đúng mốc thời gian – kê khai đúng – lưu hồ sơ đầy đủ.